手机浏览器扫描二维码访问
GWAS分析结果的
P
值输入软件中即可计算。
4.Setscreentest
该方法基于Fisher检验去综合基因的
P
值或通路的
P
值,在计算过程中考虑了SNP之间的相关结构或连锁不平衡。
该方法在计算过程中调用了PLINK分析软件。
在通路分析或基因集分析中,一般考虑至少一个SNP出现在通路或者基因集中。
该方法和FORGE方法相似。
5.ALIGATOR
该方法和前面列举的方法有所不同,在分析过程中采用随机抽样10万次的形式去评估基因集的大小,并且应用了bootstrap方法计算经验性
P
值。
(四)蛋白质交互网络(protein-proteininteraction,PPI)
在复杂疾病的遗传研究中,常常得到的结果是一组易感基因,为了观察基因间蛋白质水平的关系,需要对结果进行后续分析。
蛋白质的相互作用是指蛋白质分子间的相关性,并从生物化学信号转导和遗传网络角度去研究这种关系。
生命的基本过程是不同蛋白质在时空上有序协同作用的结果;信号传导是利用蛋白质相互作用将信号从细胞外部转到细胞内部;代谢也是蛋白质复合体或者多蛋白网络协同作用来实现的。
因此蛋白交互作用在生物过程和疾病研究中起着重要的作用。
蛋白质交互数据库,目前已有大量的蛋白质交互数据信息存储在公共的数据库里,从而提供了大量的蛋白质交互信息,其中包括BOND数据库、DIP数据库、MIPS数据库、GRID数据库、MINT数据库和intAct数据库等。
从这些数据库中可以得到不同物种的蛋白质交互信息及其实验证据。
1.BOIN数据库(http:bind.ca)
该数据库是生物分子对象网络数据库(BiomolecularObjectNetworkDatabank)中最重要的组成部分。
主要记录蛋白质相互作用在内的生物分子间的相互作用信息,并将其中的信息分为经过人工检查的可信信息和高通量数据信息。
用户可以通过网络工具查找相互作用信息也可以将相互作用信息下载到本地进行分析。
2.DIP数据库(http:dip.doembi.ucla.edu)
该数据库中也含有人工检查的可用信息和自动计算方法所获取的高通量数据。
该数据库可以按照不同物种选择下载不同格式的蛋白质相互作用信息。
用户可以通过网络信息工具查询相互作用信息也可以将相互作用信息下载到本地进行处理。
3.MIPS数据库(http:.helmholtz-muenchen.deenmips)
该数据库是跨物种的综合数据库,也包含多种其他的数据库。
其中的CYGD数据库提供了比较完整的酵母蛋白质交互作用信息。
而MIPS哺乳动物数据库MPPI则提供了经过人工检查的哺乳动物蛋白质相互作用信息。
用户可以通过网络信息工具查询相互作用信息也可以将相互作用信息下载到本地进行处理。
4.BioGrid数据库(http:.thebiogrid.cc)
该数据库是一个包含多物种蛋白质交互作用的数据库。
该数据库中既包括物理作用信息也包括遗传交互作用信息。
物理交互作用信息是指蛋白间通过空间构想或者化学键彼此发生的结合或化学反应。
世人皆有罪,罪行天地定,入我圣狱,生死由我不由天!同是普通人的楚峰,偶然之间得到了一个可以升级的监狱,历经无数年的努力,他的监狱成了关押圣人的囚牢!你是圣人?不好意思,这里便是掌控圣人生死的地方!quot...
张北野宋倩作者她们说我超凶的张北野宋倩txt下载某天,高冷的校花突然找到张北野。我一个周后会死,你能不能娶我?张北野一脸懵逼,你特么有病吧?你以后会名震天下,富可敌国,妻妾成群,只有你能救我。...
混沌求永生,炼阳化九重。圣人为蝼蚁,玄黄一小童。宇宙中的四象至圣为何要颠覆混沌重开纪元?一个玄黄大陆的卑微小童,如何一步步成长成为比肩四圣的存在?炼精化气,炼气化神,炼神还虚,炼虚合道!能否炼出一个属于自己的宇宙?问题的答案,在炼阳之中。但是无尽的精彩过程,却在你们天天的追看中。...
热血少年,青春飞扬!第一部打英雄联盟约了个妹子让我给她上分,自此便踏上了一段征程!第二部荣耀的舞台是强者的归属地,弱者,只能被淘汰!第三部昔日的辉煌已成过往云烟,电竞的残酷就在于,当我回首过往的时候,明明只是几年的光阴,却如浮生大梦,被遗忘在某一个角落。...
陈锐在末世挣扎了十年,一生不如意的他竟然在睡梦中被一枚外星芯片砸到了脑袋,莫名奇妙的重生到十年前。...
一朝穿越,现代白领唐可可穿到了无父无母的孤儿身上。住山洞,挖野菜,吃了上顿没下顿。唐可可挽起袖子,带领四兄妹一边斗极品虐渣渣,一边发家致富两不耽误。买房子,上私塾,一家人齐心协力,日子越过越红火。一时好心接济了落魄秀才李煜然,可这家伙天天阴魂不散刷存在感。...